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知网中有关拟南芥研究文献的定量分析

来源:学术堂 作者:周老师
发布于:2015-10-31 共7007字
摘要

  拟南芥(Arabidopsis thaliana)属十字花科拟南芥属小型草本短命植物,产于朝鲜、日本、俄罗斯、印度、伊朗、土库曼斯坦、欧洲、非洲和北美洲等地,在我国华东(江苏南部、安徽)、中南(湖北)、西北(新疆塔城、陕西勉县)和西部(西藏普兰、聂拉木、定日、林芝、察雅、芒康)亦有分布[1-3].该种因个体小、生命周期短、种子量大、受控条件下生长良好、易于自花或异花受精、基因组少、重复序列少及易于诱变等优点,已成为一种研究植物生命奥秘理想的模式生物,现已成为遗传学、分子生物学、发育生物学、生态学及进化生物学等众多研究领域的理想材料,从而受到国内外学者的普遍重视。目前,拟南芥的研究工作大多集中在形态发生与生长发育的分子生物学、基因的克隆、转化、表达与调控等方面[4].

  然而,尽管拟南芥的研究在中国已有数十年,但通过文献计量学分析拟南芥的研究现状、特征及发展趋势的相关研究尚鲜见报道。基于此,现采用文本挖掘技术对中国知网核心期刊数据库收录的有关拟南芥研究文献进行定量分析,从期刊发文量的年际变化、文献研究机构、文献作者核心着者群等多个维度进行统计分析,其分析结果可望为今后生物学拟南芥领域研究目标的凝练、研究团队的合作、研究机构的互助、研究内容的突破等提供科学判断的现实依据。

  1材料与方法

  1.1研究材料

  通过CNKI数据库[5],以“拟南芥”为篇名,在“精确”匹配模式下、以“核心期刊”为界定范围进行检索、查询,获得以文献数量为表征的各项检索结果。经过筛选,共获得1 184篇与“拟南芥”关系最为紧密的研究文献。

  1.2研究方法

  文献计量分析法是采用数理统计学方法来定量描述、评价和预测学术现状与发展趋势的图书情报学研究分支,其研究优势表现为显着的客观性、定量化、模型化[6-7].结合文献计量学的分析方法,以“1979-2013年拟南芥研究的核心期刊专题文献数据库”作为研究样本,从多个维度对数据库所表征的文献信息进行计量学的分析。

  为了进一步分析拟南芥研究文献作者的合作程度,引入合作度和合作率2个重要评价参数,其反映了某一领域论文合作者智能发挥的程度,一般来讲数值越高,合作智能发挥越充分,其具体计算公式如下[10]:

  合作度=某种期刊在一定时期内作者总数/论文总数;合作率(%)=某种期刊在一定时期内合着论文数/论文总数×100.

  1.3数据分析

  利用Excel将筛选的研究文献的主要指标参数手工输入数据库中,构建题为“1979-2013年拟南芥研究的核心期刊专题文献数据库”,并进行相关数据的分析。

  2结果与分析

  2.1文献数量的年际分布

  文献数量的年际分布可以在一定程度上反映相关领域和学科的发展速度,以论文发表的年份作为分类依据,全面统计了1979-2013年以“拟南芥”为论题的文献数量,统计结果显示,1979-2013年共发表拟南芥研究论文1 184篇,年均33.9篇。

  由图1可知,35年间其研究发展大致经历了3个阶段:第一阶段是1979-2000年,随年际变化论文数量整体呈上升状态,但数量变化在平衡中多有起伏,其中1980-1985年无核心期刊论文发表,随后论文数量逐渐增多,22年间共发表论文43篇,仅占发文总量的36%,平均每年仅为1.95篇,远低于35年间33.9篇的平均水平。说明这个时期关注拟南芥的研究群体数量不足,研究力量相对薄弱,再加之试验操作技术缺乏、试验设备落后,拟南芥的研究进展相对缓慢,因而相关的研究成果也较少,这一时期拟南芥研究文章数量维持在一个较低的水平,研究处于起始阶段。


  第二阶段是2001-2011年,拟南芥研究论文数量呈现指数增长趋势,这11年间发表论文总量为878篇,占发文总量的74%,年均发文量79.8篇,为平均值的2.4倍,2011年达到单年文献数量的最高峰,为162篇,说明这一时期很多学者及研究机构致力于拟南芥的研究,大量的研究成果在这一时期涌现,究其原因:一是拟南芥基因组测序工作的完成,2000年底《自然》杂志(Nature)报道了拟南芥完整基因组测序工作完成,并且发表了其完整的基因组序列,这项工作的完成为拟南芥功能基因组学、蛋白质组学的研究奠定了基础,也使人类跨种甚至跨界的揭示生命活动的基本规律成为可能,这大大拓展了研究者的生物学视野,促进了国内学者在这一领域的研究。二是自然科学的新技术、新方法促进了拟南芥的纵深研究。凭借分子生物学的新技术展开拟南芥微观领域的研究,尤其在拟南芥中进行突变体的分离、图位克隆和基因表达分析以及抗逆基因的筛选;宏观领域则以拟南芥的生态学、进化生物学和生物地理学为主要研究领域。

  第三阶段是2012-2013年,拟南芥研究文献的数量略有下降和波动,但基本维持在130篇以上。自2011年后,拟南芥的研究文献数量开始下降,随年际变化文献量呈“S”型变化趋势,这一时期发文总量为265篇,年均132.5篇,占发文总量的22.4%,但其年均发文量为35年间平均值的3.9倍,依据文献量的变化曲线可以推断,未来一段时间内研究拟南芥的文献数量将仍然维持目前水平,且保持相对稳定,拟南芥的研究将更加深入、理性。

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