不同长度的蛋白质多肽残基的电荷分布

　　生物蛋白质[1]的性质及其生理作用十分的复杂多样，在实验不断向前探索的同时，理论化学方面针对生物大分子的研究也在不断的发展。理论上研究蛋白质性质时，考虑局部残基的性质对整个分子性质的影响是不可忽视的的。

　　本文使用原子 - 键电负性均衡方法 （ABEEMσπ），快速和准确计算出不同长度的蛋白质多肽残基的电荷分布。为后来使用 ABEEMσπ 模型计算 Fukui 函数和整体软度判断大分子的整体反应活性，从而更好地应用蛋白质性质以及生理作用反应原理提供合理的参数体系。

　　1 计算方法和细节

　　1.1 计算方法

　　在密度泛函理论的基础上，杨与合作者提出了原子 - 键电负性均衡方法（ABEEMsp），该模型将分子体系的单电子密度不仅划分为原子区域，而且还有化学键区域 （ 包括 s 和 p 键 ） 和孤对电子区域。利用 ABEEMsp 方法，任意一个区域（i）的有效电负性可以表达为。

　　可以得到n+1个关于电荷和电负性为未知量的线性方程组。如果每一个位点的价态电负性*ic和价态硬度*ih已知，就可以快速的求出分子中的各个位点的电荷分布和分子的电负性。